Eclipse 3.3.1.1 + CDT 4.0.0.200709241202 + MinGW 5.1.3 という環境でのお話。
DLLに依存するプロジェクトを作って、library pathを設定しても、Eclipseから実行できない。DLLと実行ファイルを同じフォルダにコピーして、実行ファイルを実行してやるとできる。Eclipseがlibrary pathを処理できていないんじゃないか？
とりあえず、実行ファイルが生成されるフォルダにDLLもコピーするスクリプトを書いた。library pathと同じことを書くのは面倒だな。